Na APAE-JP, ao psicopedagogo são atribuídas diferentes tarefas, todas compatíveis com a sua habilitação. Em primeira instância, ele identifica a capacidade de simbolização do usuário, caracterizando o funcionamento da linguagem oral e escrita, após a avaliação psicológica e clínica. O psicopedagogo faz sugestões fundamentadas sobre os procedimentos pedagógicos apropriados para cada usuário e, junto com o corpo técnico da escola, ele é responsável pela formação de turmas para escolarização e para as oficinas pedagógicas ou terapêuticas. A ele também cabe lidar com a estimulação precoce das crianças cuja capacidade de simbolização não possibilita a inserção na escola.