O Projeto de Informática aplicado à educação foi implantado através do PROINESP em parceria com FENAPAE / SEESP / MEC, com o objetivo de proporcionar as pessoas com necessidades especiais o acesso às novas tecnologias e viabilizar a inclusão dos mesmos ao mundo informatizado. A informática educativa é um recurso que permite um melhor desenvolvimento de seus usuários. A APAE-JP faz uso de softwares específicos que possibilitam o desenvolvimento da coordenação motora fina, percepção visual e auditiva, além de estimulação ao processo cognitivo. O laboratório atende aos usuários matriculados na escola, sendo utilizado como meio para fixação das atividades realizadas em sala de aula; e aos usuários da clínica que recebem atendimento pedagógico. Além das Pedagogas também fazem uso do laboratório a Fonoaudióloga e a Psicóloga, que através dos programas do computador possibilitam seus atendimentos de forma dinâmica e interativa com o paciente. Também a Fisioterapeuta e a Terapeuta Ocupacional participam do processo funcional do laboratório orientando as adequações necessárias para o melhor uso do computador, dependendo da necessidade específica de cada usuário. A equipe é formada por multiprofissionais, que trabalham de forma integrada uns com os outros.