Fonoaudiologia é a ciência que estuda a linguagem normal e seus processos patológicos. O atendimento fonoaudiológico abrange ampla faixa de idade, desde o recém-nascido até o idoso. Os objetivos da fonoaudiologia na APAE-JP são: realizar avaliações, dar diagnósticos e parecer fonoaudiológico, encaminhar quando necessário a outros profissionais de áreas afins; planejar e realizar terapia fonoaudiológica, provendo estimulação da linguagem e do sistema estomatognático, trabalhando funções de respiração, mastigação, deglutição e fala, facilitando a função de alimentação; orientar o paciente e a família quanto à estimulação da linguagem oral e escrita, motricidade orofacial, voz e audição; desenvolver trabalho preventivo; contribuir na realização de planejamentos, desenvolvimento e execução de programas fonoaudiológicos por meio de palestras e orientações aos familiares e/ou responsáveis pelas pessoas com deficiência.